Pokémon: Mewtwo's Counterattack Evolution

Ceritanya bercerita tentang sekelompok ilmuwan gila yang, demi impian mereka sendiri, mengembangkan mesin yang dapat menyalin Pokémon hanya dengan beberapa gen, dan menyalin Pokémon terkuat di dunia yang mereka temukan ke dalam Mewtwo, yang memiliki kemampuan lebih kuat dari Mew. Namun ketika Chaomeng terbangun, dia melarikan diri karena tidak dapat menemukan jati dirinya. Bos Tim Rocket muncul di depan Chaomeng dan menggunakan kata-kata manis untuk menarik Chaomeng yang kehilangan dirinya untuk bekerja untuknya. Namun, setelah beberapa saat, Chaomeng kembali bingung dengan dirinya sendiri. Chaomeng kembali ke pulau yang menirunya dan memutuskan untuk memulai pertempuran balas dendam.